Anteriormente no Apache Tomcat 5.5, existiam 3 diretórios que pudessem conter JARs de bibliotecas, para serem compartilhados entre as aplicações. Na época, era uma confusão.

À partir da versão 6, tudo ficou mais simples, com um único diretório: lib. Na versão 7 isto foi mantido. Porém pode ser o caso de se querer usar um diretório separado para bibliotecas de frameworks. Misturar isso com os JARs do Tomcat parece arriscado e insensato.

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